بررسی بیوانفورماتیکی و بیان خانواده ژنی snrk۲ در گیاه جو
Authors
abstract
تنش های غیرزیستی از مهم ترین عوامل محدود کننده ی عملکرد گیاهان زراعی و پروتئین کینازهای snrk2 از تنظیمکننده های کلیدی پاسخ گیاهان به تنش های غیرزیستی می باشند. با توجه به اهمیت اقتصادی، سطح زیر کشت و تحمل گیاه جو به تنش های غیرزیستی، در این تحقیق اعضای خانواده ی snrk2 در گیاه جو شناسایی و مورد بررسی قرار گرفته اند. بههمین منظور توالی های حفظ شده خانواده snrk2 در پایگاه های اطلاعاتی مختلف همچون ncbi و پروژه ژنوم جو، با ابزار tblastn در بین توالی های ثبت شده برای گیاه جو جستجو شدند. در نتیجه 10 عضو یافت شدند hvsnrk2.1) تا hvsnrk2.10) که 8 عضو آن تاکنون گزارش نشده بودند. اعضای خانواده ی snrk2 جو با اعضای این خانواده در آرابیدوپسیس و برنج همردیف و درخت فیلوژنتیک رسم شد. تعیین جایگاه کروموزومی، آنالیز پروموتر و تعریف ساختار ژن ها انجام شد و الگوی بیان هر ژن در اندام ها، تیمارها و ارقام مختلف بر اساس داده های ریزآرایه مورد بررسی قرار گرفت. نیمی از اعضای این خانواده روی کروموزوم 2 و بقیه روی کروموزوم های 1، 4، 5 و 6 قرار داشتند. تعداد اینترون در اعضای این خانواده از صفر تا 8 متغیر بود. 19 نوع عامل سیس شامل عوامل مؤثر در پاسخ به تنش های غیرزیستی، بر روی پروموتر اعضای خانواده ژنی hvsnrk2 شناخته شد. بیان ژن hvsnrk2.6 توسط خشکی، شوری و سرما القا شده و بهنظر می رسد در انتقال پیام این تنش ها و ایجاد تحمل به آنها نقش مهمی ایفا کند. امید است بتوان از این ژن برای اصلاح و دست ورزی گیاهان در جهت تحمل به تنش های غیرزیستی بهویژه خشکی بهره برد.
similar resources
بررسی بیوانفورماتیکی و بیان خانواده ژنی SnRK2 در گیاه جو
تنشهای غیرزیستی از مهمترین عوامل محدود کنندهی عملکرد گیاهان زراعی و پروتئین کینازهای SnRK2 از تنظیمکنندههای کلیدی پاسخ گیاهان به تنشهای غیرزیستی میباشند. با توجه به اهمیت اقتصادی، سطح زیر کشت و تحمل گیاه جو به تنشهای غیرزیستی، در این تحقیق اعضای خانوادهی SnRK2 در گیاه جو شناسایی و مورد بررسی قرار گرفتهاند. بههمین منظور توالیهای حفظ شده خانواده SnRK2 در پایگاههای اطلاعاتی مختلف همچ...
full textبررسی بیوانفورماتیکی و بیان خانواده ژنی SnRK2 در گیاه جو
تنشهای غیرزیستی از مهمترین عوامل محدود کنندهی عملکرد گیاهان زراعی و پروتئین کینازهای SnRK2 از تنظیمکنندههای کلیدی پاسخ گیاهان به تنشهای غیرزیستی میباشند. با توجه به اهمیت اقتصادی، سطح زیر کشت و تحمل گیاه جو به تنشهای غیرزیستی، در این تحقیق اعضای خانوادهی SnRK2 در گیاه جو شناسایی و مورد بررسی قرار گرفتهاند. بههمین منظور توالیهای حفظ شده خانواده SnRK2 در پایگاههای اطلاعاتی مختلف همچ...
full textآنالیز بیوانفورماتیکی خانواده های ژنی مرتبط با دفاع اکسیداتیو گیاه
چکیده تنش اکسیداتیو یک تنش ثانویه است، علامت ندارد و در پس زمینه همه تنش ها وجود دارد و مهمّترین تنش در دنیای بیولوژی گیاهی و جانوری است. مثلاً شوری یک تنش اولیه است که پس از اعمال در گیاه، منجر به تولید ros ها که همان تنش اکسیداتیو است، می شود. گیاهان مکانیسم های مهمّی را برای مقابله با آنها در خود توسعه داده اند. ros ها یا انواع اکسیژن های واکنشی ، به عنوان مواد جهش زا در واکنش ها عمل می کنند ...
15 صفحه اولشناسایی، طبقه بندی و آنالیز بیان بیوانفورماتیکی خانواده ژنی عوامل نسخه برداری NAC در ژنوم Hordeum vulgare cv. Morex
خانواده ژنی NAC یک خانواده بزرگ عوامل نسخهبرداری اختصاصی گیاهی است که نقشهای متنوعی در مراحل نمو گیاهی و پاسخ به تنشها ایفا میکند. با تکمیل پروژه توالییابی ژنوم Hordeum vulgare cv. Morex امکان مطالعات بیوانفورماتیکی خانواده ژنی NAC در جو فراهم گردید. در این پژوهش با استفاده از پایش ژنومی، در کل 73 ژن غیرتکراری رمزکننده NAC در توالیهای ژنومی Hordeum vulgare cv. Morex شناسایی شد. یک درخت تب...
full textبررسی بیان خانواده ژنی دهیدرینها در ژنوتیپهای حساس و متحمل جو وحشی و زراعی در شرایط تنش خشکی
دهیدرینها دومین گروه از پروتئینهای بسیار آبدوست از گروه LEA هستند که در شرایط کمآبی و دمای پایین در گیاهان تجمع مییابند و به نظر میرسد در ایجاد تحمل به تنش نقش مهمی دارند. به منظور بررسی اهمّیت دهیدرینها در پاسخ ژنوتیپهای حساس و متحمل جو به خشکی، آزمایشی به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی در گلدان روی ارقام زراعی یوسف، موروکو و اکوتیپ جو وحشی اسپانتانئوم (Hordeum spontaneum) به عن...
full textشناسایی، طبقه بندی و آنالیز بیان بیوانفورماتیکی خانواده ژنی عوامل نسخه برداری NAC در ژنوم Hordeum vulgare cv. Morex
خانواده ژنی NAC یک خانواده بزرگ عوامل نسخهبرداری اختصاصی گیاهی است که نقشهای متنوعی در مراحل نمو گیاهی و پاسخ به تنشها ایفا میکند. با تکمیل پروژه توالییابی ژنوم Hordeum vulgare cv. Morex امکان مطالعات بیوانفورماتیکی خانواده ژنی NAC در جو فراهم گردید. در این پژوهش با استفاده از پایش ژنومی، در کل 73 ژن غیرتکراری رمزکننده NAC در توالیهای ژنومی Hordeum vulgare cv. Morex شناسایی شد. یک درخت تب...
full textMy Resources
Save resource for easier access later
Journal title:
زیست فناوری گیاهان زراعیجلد ۵، شماره ۱۲، صفحات ۲۵-۳۸
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023